英国清教「必要之恶教会」全体成员VS骑士团长率领的「骑士派」，最大的战斗即将拉开帷幕！上条当麻终于找到了政变的主谋。在那里遇到的是「神之右席」的后方之水——！当科学与魔法交汇之时，故事就从此开始——！
隶属于「英国清教」的大本营——伦敦，这座魔法之都因以骑士团长为首的「骑士派」发动政变而陷落。其影响波及整个英国，全国各地出现了市民被军队拘押的异常事态。在「骑士派」的「变革」进行中，拥有魔法师的「清教派」在各处继续抵抗战斗。
为了拯救茵蒂克丝而前往福克斯通的上条当麻，终于找到了政变的主谋。而在那里等待他的是，「神之右席」的后方之水！并且，他所挥剑指向的人，是英国王室第二公主凯莉莎……！
当科学与魔法交汇之时，故事就从此开始——！