最强的能力者·一方通行VS武装集团「猎犬部队」！！ 最弱的无能力者·上条当麻VS前方之风！！ 当科学与魔法交汇之时，故事就从此开始——！
罗马正教「神之右席」的一员，「前方之风」入侵了学园都市。她操控的谜之魔法使得城市机能完全瘫痪，大部分人失去意识而倒下。
她的目标是上条当麻。
罗马正教正式认定的敌人。
与此同时，
最强能力者·一方通行为了保护支持他的少女「最后之作」，与科学家木原数多率领的武装集团「猎犬部队」展开激战。
魔法与科学，两场灾难同时袭击学园都市。
上条当麻、茵蒂克丝、一方通行、最后之作。当四者的四种心情交汇之时，故事就从此开始——！